1899(明治32年)
9月,拆解原屬於台灣鐵道株式會社之美製四輪機關車,以進行本地職工之組裝及修繕教育。
本年度製作貨車5輛。
重要事件:4月,設臨時鐵道敷設部。
11月,台灣總督府鐵道部成立。
1898(明治31年)
8月,颱風沖毀木製淡水橋後,淡水橋機關庫所在之機關車修繕則雇請渡船將欲修理部件送至工場修理(迄至1900年止)。
1897(明治30年)
重要事件:3月,臨時台灣鐵道隊撤廢,鐵道業務移轉給4月成立的台灣總督府民政局通信部鐵道掛。台灣鐵道的性質正式由軍事轉為民間。
1896(明治29年)
4月,位於臨時台北兵器修理所的鑄物場竣工。陸軍撤除臨時台北兵器修理所,原址設台北砲兵工場。
1895(明治28年)
10月,將原本在台北機關庫的車輛修繕業務,借用臨時台北兵器修理所的一部分空間新設鑄物場,進行鐵道及車輛相關的全部的修繕工作。
重要事件:8月25日,臨時台灣鐵道隊成立,取代原本的台灣鐵道線區司令部。